Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW4

Clec3a, C-type lectin domain family 3 member A, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3aQ9EPW4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec3aQ9EPW4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec3aQ9EPW4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec3aQ9EPW4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec3aQ9EPW4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec3aQ9EPW4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec3aQ9EPW4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec3aQ9EPW4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec3aQ9EPW4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec3aQ9EPW4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clec3aQ9EPW4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms