Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clstn1Q9EPL2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms