Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP51

Vmn1r50, Vomeronasal type-1 receptor 50, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r50Q9EP51 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r50Q9EP51 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r50Q9EP51 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms