Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pop7Q9DCH2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop7Q9DCH2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms