Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syde1Q9DBZ9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syde1Q9DBZ9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms