Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Med29Q9DB91 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med29Q9DB91 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms