Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnpy3Q9DAU1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnpy3Q9DAU1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnpy3Q9DAU1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnpy3Q9DAU1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnpy3Q9DAU1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnpy3Q9DAU1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnpy3Q9DAU1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnpy3Q9DAU1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnpy3Q9DAU1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cnpy3Q9DAU1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnpy3Q9DAU1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms