Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DAE8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DAE8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DAE8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DAE8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DAE8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DAE8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DAE8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DAE8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DAE8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9DAE8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9DAE8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DAE8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DAE8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9DAE8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9DAE8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DAE8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms