Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
1700018B08RikQ9DA83 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
1700018B08RikQ9DA83 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700018B08RikQ9DA83 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms