Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smco2Q9DA21 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smco2Q9DA21 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smco2Q9DA21 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms