Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sgf29Q9DA08 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sgf29Q9DA08 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms