Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Actrt1Q9D9J3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Actrt1Q9D9J3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms