Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot8Q9D8X5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cnot8Q9D8X5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot8Q9D8X5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms