Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tvp23bQ9D8T4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tvp23bQ9D8T4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms