Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms