Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmigd1Q9D7L8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmigd1Q9D7L8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmigd1Q9D7L8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms