Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2310002L09RikQ9D7L5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2310002L09RikQ9D7L5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
2310002L09RikQ9D7L5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
2310002L09RikQ9D7L5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
2310002L09RikQ9D7L5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
2310002L09RikQ9D7L5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms