Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capns2Q9D7J7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capns2Q9D7J7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capns2Q9D7J7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
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