Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgm5Q9D7I9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgm5Q9D7I9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms