Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn23Q9D7D7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn23Q9D7D7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms