Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Klhl40Q9D783 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhl40Q9D783 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms