Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gbe1Q9D6Y9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gbe1Q9D6Y9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms