Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cul5Q9D5V5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cul5Q9D5V5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cul5Q9D5V5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms