Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrameQ9D4Z5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrameQ9D4Z5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms