Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4931428L18RikQ9D4S9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4931428L18RikQ9D4S9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms