Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ribc2Q9D4Q1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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