Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul2Q9D4H8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cul2Q9D4H8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Cul2Q9D4H8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cul2Q9D4H8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms