Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syce1Q9D495 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syce1Q9D495 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Syce1Q9D495 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1Q9D495 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1Q9D495 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms