Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph14Q9D3W1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rsph14Q9D3W1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms