Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R6

Coa3, Cytochrome c oxidase assembly factor 3 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Coa3Q9D2R6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Coa3Q9D2R6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Coa3Q9D2R6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms