Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Necap2Q9D1J1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms