Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1F3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D1F3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D1F3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D1F3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D1F3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1F3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D1F3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms