Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TbcbQ9D1E6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TbcbQ9D1E6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms