Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cthrc1Q9D1D6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cthrc1Q9D1D6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms