Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ube2cQ9D1C1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ube2cQ9D1C1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ube2cQ9D1C1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ube2cQ9D1C1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ube2cQ9D1C1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube2cQ9D1C1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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