Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syf2Q9D198 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms