Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zbed3Q9D0L1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zbed3Q9D0L1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.6 ms