Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2e1Q9D0D5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf2e1Q9D0D5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms