Protein–RNA interactions for Protein: Q9D061

Acbd6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd6Q9D061 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acbd6Q9D061 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acbd6Q9D061 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Acbd6Q9D061 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Acbd6Q9D061 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Acbd6Q9D061 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acbd6Q9D061 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms