Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ssbp3Q9D032 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp3Q9D032 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms