Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Shmt2Q9CZN7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shmt2Q9CZN7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shmt2Q9CZN7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms