Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PmpcbQ9CXT8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PmpcbQ9CXT8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms