Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF7

Chd1l, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like, mousemouse

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Length 900 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1lQ9CXF7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chd1lQ9CXF7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chd1lQ9CXF7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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