Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm5Q9CXE0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms