Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ddx28Q9CWT6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms