Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Raver1Q9CW46 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Raver1Q9CW46 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms