Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MINDY3Q9CV28 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MINDY3Q9CV28 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms