Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rhobtb3Q9CTN4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rhobtb3Q9CTN4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rhobtb3Q9CTN4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms