Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRW3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRW3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRW3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9CRW3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CRW3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRW3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRW3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRW3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9CRW3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.1 ms