Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rer1Q9CQU3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rer1Q9CQU3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms